• SEKRETARIAT (SEKRETARIS)
  •    SUB BAGIAN RENCANA KERJA, MONITORING DAN EVALUASI
  •    SUB BAGIAN UMUM DAN APARATUR
  •    SUB BAGIAN KEUANGAN DAN ASET
  •    Jabatan Fungsional Ahli Madya
• BIDANG LALU LINTAS JALAN
  •    SEKSI MANAJEMEN DAN REKAYASA LALU LINTAS JALAN
  •    SEKSI SARANA DAN PRASARANA LALU LINTAS JALAN
  •    SEKSI KESELAMATAN LALU LINTAS JALAN
  •    Jabatan Fungsional Ahli Madya
• BIDANG ANGKUTAN JALAN
  •    SEKSI ANGKUTAN ORANG DALAM TRAYEK
  •    SEKSI ANGKUTAN ORANG TIDAK DALAM TRAYEK DAN MULTI MODA
  •    SEKSI TERMINAL
  •    Jabatan Fungsional Ahli Madya
• BIDANG PELAYARAN
  •    SEKSI ANGKUTAN LAUT
  •    SEKSI ANGKUTAN SUNGAI, DANAU DAN PENYEBERANGAN
  •    SEKSI SARANA DAN PRASARANA PELAYARAN
  •    Jabatan Fungsional Ahli Madya
• BIDANG PENGEMBANGAN TRANSPORTASI
  •    SEKSI PENGEMBANGAN SISTEM TRANSPORTASI DAN PEMADUAN MODA
  •    SEKSI DAMPAK LINGKUNGAN PERHUBUNGAN
  •    SEKSI TEKNOLOGI DAN INFORMASI PERHUBUNGAN
  •    Jabatan Fungsional Ahli Madya